As categorias são exibidas no topo da loja e funcionam como um menu, para que possam ordenar estas categorias segue o passo a passo.
1 – Acesse o painel admin -> Aparência -> Personalizar -> Menus ->Main
2 – No próximo passo basta Clicar na categoria e arrastar, após feito como deseja é somente publicar.
Caso a alteração não tenha sido confirmada, realize a limpeza do cache.
https://help.widecommerce.com.br/artigo/limpeza-de-cache-do-navegador-woocommerce/